La materia tiene como finalidad que el estudiante adquiera las habilidades técnicas para asesorar a los productores en la producción de productos bajo el esquema de agricultura protegida, induciendo al mínimo el consumo de productos químicos, acciones que amortiguaran los efectos negativos y así para proteger el medio ambiente y la salud de los consumidores.


El estudiante estudiará al insecto plaga y el comportamiento de ciertas enfermedades para establecer los mecanismos de acción preventivos  y así disminuir los riegos de presencia de individuos que potencialmente puedan causar daño económico en la producción. 



El aprendizaje de la Química representa un reto en el cual es necesario hacer uso de todos los recursos que permitan el manejo de conceptos, simbología y procesos  químicos, buscando el desarrollo de destrezas y competencias científicas y tecnológicas en el estudio y la interpretación de algunos fenómenos químicos. 
Esta asignatura aporta al perfil del Ingeniero en Innovación Agrícola sustentable e Ingeniero Agrónomo, la capacidad para desarrollar proyectos en donde apliquen los conocimientos básicos referentes a los compuestos químicos y sobre todo los efectos a la salud y al ambiente.  

Esta asignatura aporta al perfil del Ingeniero en Innovación Agrícola Sustentable la capacidad de participar con organizaciones, grupos de trabajo y productores independientes interesados en la aplicación de buenas prácticas agrícolas y de manufactura.

Su importancia radica en que le permite integrar conocimientos de inocuidad alimentaria y bioseguridad, para aplicarlos en la prevención o atenuación de riesgos, remediación de sitios contaminados o detección de alimentos contaminados.
La asignatura está conformada por 6 unidades. 

La primera unidad induce en el estudiante un criterio fundamentado para percibir los riesgos reales y potenciales del uso o abuso de organismos y productos liberados al ambiente. La segunda proporciona al estudiante el contexto de la regulación de la inocuidad alimentaria. La tercera unidad familiariza al estudiante con distintos estudios de caso relacionados con la contaminación de alimentos. La cuarta unidad relaciona al estudiante con técnicas de análisis para detectar productos de riesgo. La quinta unidad enfatiza sobre los efectos del uso de transgénicos en México y otros países. Finalmente, la sexta unidad provee al estudiante de algunas estrategias de biorremediación y fitorremediación de sitios contaminados.